一个视图的传统和分子检测方法等的细菌病原体

文摘

致病性种子传播细菌病原体的检测是一个重要的方面疾病管理。存在病变的种子在种子一不能可靠地检测到视觉检查。射线照相检测种子提供了一种有效的、非破坏性的方法来确定内部种子损伤。然而,随着分子技术的发展,强调在细菌的识别和分类已经从传统的方法更分子的方法。DNA分析技术如聚合酶链反应(PCR)和随机扩增多态性(RAP)分析是最常用的工具。核酸提取仍然是必要的在许多情况下,在实践中抑制问题理论上降低分子的检测灵敏度。总的来说,分子技术基于PCR扩增,尤其是实时PCR是导致高吞吐量,更迅速和更精确的检测方法为最严重的种子传播细菌病原体

关键字

种子,种子承担,检测、传统方法、核酸分子的方法

介绍

作物生产的种子是最重要的输入。许多植物病原体种子传播,会引起巨大的农作物损失;减少植物生长和作物的生产力。种子是最重要的主要来源培养液对许多细菌疾病暴发(1,2]。确定种子传播病原体的存在允许管理者应用适当的控制或修改管理实践,以避免未来的问题(3]。因此,病原体免费健康的种子是急需的植物种群和良好的收成。种子健康检测因此经常在大多数国家国内种子进行认证,质量评估和植物检疫4]。种子健康检测是一种积分中所有种子公司疾病风险管理和提高种子的发芽势最终导致增加的作物生产5]。

细菌被认为是一群独特的植物病原体能够诱导重大损失在不同作物种植在世界各地不同的国家。各种方法基于形态学、生化、生理、免疫学和核酸申请他们的检测特点,分化和识别不同级别的敏感性,特异性和可靠性(6]。

植物病原真菌细菌,进行或真正的种子和块茎等无性繁殖植物材料,生长情况、岩屑和洞穴形成的主要来源下赛季感染的作物(7]。它可以生存在种子或种子本身还长。感染的大约10000年种子能引起细菌性疾病的爆发8]。因此,有必要检测细菌病原体在这些种植材料,防止引入新的细菌病原体(s)到新的区域或限制现有的细菌病原体的传播地理位置(9]。及时探测和适当的识别与疾病相关的因果代理的种子被认为是最重要的问题在制定可持续管理的植物细菌性疾病。

文献综述

从传统到分子

感染细菌病原体的种子可能不会被视觉检查在大多数情况下。内部种子内容可以被切开的种子检验和寻找疾病的症状10]。种子传播的病原体也可以存在于种子没有明显疾病症状(11]。因此许多检测方法已经开发多年来对各种细菌等病原体。然而,种子传播细菌病原体的检测在很大程度上仍然依赖于太经典形态学鉴定等活动,显微镜观察、生化特征和文化资产(12]。基于核酸的检测方法克服,现在已经出现补充这些限制访问。

生物分析

这个过程是高度选择性,因为它依赖于宿主病原体的特异性相互作用。它的灵敏度不太放心,因为接种阈值可能取决于被测试的植物品种,波动环境条件、生育和其他因素。此外,工厂检查员的可靠检测低发病率的疾病是一个关键因素,因为它常常需要视觉识别单一病灶在成千上万的植物。尽管如此,grow-outs被广泛使用和接受的最终确定种子的感染状况。因为grow-outs依赖症状表现,一个积极的结果通常是无可辩驳的证据表明细菌是存在的,可行的,和致病性13]。另一方面,标准协议基于隔离的种子传播细菌病原体的检测,进一步识别耗时,而不是总是敏感,不够具体。因此,他们显然不适合大量样品的常规分析(12]。他们有低再现性的鉴定表型性状和规律缺乏系统发育意义(14]。

核酸技术

检测方法的选择取决于测试的目的。,whether the seeds are to be tested for seed certification, seed treatment, quarantine etc. If for quarantine purposes, then highly sensitive methods are preferred. In the case of conventional seed borne disease detection method, seed assays have been developed based on different technologies including visual examination; selective media; seedling grow-out tests and serological techniques. At the same time, it becomes necessary to employ special techniques for the detection of bacterial感染在种子像核酸技术15]。

最普遍适用的基于核酸的技术现在天核酸杂交技术,聚合酶链反应检测,实时聚合酶链反应和限制性片段长度多态性分析。发展DNA探针诊断特定的病原体检测(s)关心帮助,微分,和量化的人口里面的细菌种子非常迅速,尤其是已知病原体通过种子传播和其他种植材料。基于核酸技术的广泛可接受性是由于他们更敏感,完美的,详细的,比传统的方法快得多。方法像实时PCR、多重PCR和生物PCR特异性检测选项提供快速数据分析。实时PCR已成功应用于识别和量化相比,许多植物病原体敏感性有所改善,培养板测试和常规PCR (16]。因此,有必要开发和应用实时PCR测试常规种子健康测试,以提高效率,特异性和敏感性6,12,16]。

讨论和结论

一般,每一个病原体检测方法从传统的(最多最复杂的实时PCR有自己的优点和缺点,但选择最合适的一个基于其多维的重要性是至关重要的在这个时间和集成方法包括16 s rDNA测序,Biolog-phenotyping,脂肪酸甲基酯酶分析和致病性试验推荐。RNA微生物的发展使基因表达测量成千上万的基因的种子传播细菌病原体,将为选择提供数据检测的新标记。新检测协议基于分子的准确性将背后的可用性种子免费范围广泛的细菌病原体在不久的将来。

引用

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