和评论:化学》杂志上的雷竞技苹果下载研究表明
菜单e-ISSN: 2319 - 9849
e-ISSN: 2319 - 9849
Rajagopal Appavu1*,迪帕汉1和Govindaraju Munisamy2
分子生物物理单位,印度理工学院Sciences-Bangalore,卡纳塔克邦,印度
Bio-Spatial技术研究单位、环境生物技术、环境科学学院Bharathidasan大学Tiruchirappalli,泰米尔纳德邦,印度
收到日期:29/01/2016接受日期:22/02/2016发布日期:26/02/2016
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同时,分子内氢键在肽构象的研究已经引起了很多人的关注,认识到其他几个弱极性相互作用可能折叠结构发展的重要决定因素。烟草和Petsko提供了一个全面的概述弱极性相互作用的重要性,在形成蛋白质的结构。芳香环之间的交互,这是空间近似,吸引了特别关注。一项调查的近端芳香残渣对蛋白质,让烟草和Petsko表明,“苯基环重心由优惠4.5和7之间的距离,和二面角角度大约90°是最常见的”。
Aromatic-Aromatic相互作用、生物系统、蛋白质/多肽折叠,分子内。
两个芳香环之间的交互建模,作为两个四极相互作用,导致明显的距离和方向的角依赖集群芳香残留的蛋白质(板式换热器、酪氨酸和Trp) (1]。苯丙氨酸(检)残留研究芳香的交互提供了一个良好的模型,因为它缺乏任何潜在的氢键在侧链。大量的研究文献主要集中在“色氨酸拉链”(Trpzip)序列,β-hairpin稳定性是影响集群的芳香互动(2- - - - - -8]。在目前的研究中,重点是研究苯丙氨酸环之间的相互作用带进距离的约束β-hairpin脚手架。早期的研究从这个实验室4,9)和戈尔曼实验室(10),一项研究表明,在裁判。4- - - - - -8)建立了设计β-hairpin结构的原则,利用DPro-Xxx段折叠成核剂。从这个实验室研究已经提供了多达32个独立的晶体特征发夹分子。见图1板式换热器残留的放置位置2和7八肽发夹、带来一双面临板式换热器sidechains附近(图1)。这个模板可能因此被用来研究的方向偏好两个近端苯丙氨酸侧链,在溶液中,通过核磁共振方法。解决这个问题(描述的研究4- - - - - -8]。
图1:(A)的一个例子肽发夹(-L-F-V-DP-G-L-F-V-OMe段17-residue肽)和II型′β-turn,显示交互苯基环板式换热器残留的non-hydrogen键位置。(B)的示意图表示八肽发夹显示可能的芳香的交互模式。最强的互动芳香残留在合成肽发夹预计当他们放在non-hydrogen焊接位置(检查广场)的链。
芳香环之间的相互作用已经引起了广泛的兴趣计算化学领域,有相当大的注意力被集中在苯的简单的模型系统调光器(4- - - - - -8,11]。稳定aromatic-aromatic交互的能量估计使用苯二聚体作为一个模型,估计不同从-0.6到1.4千卡每摩尔。几个积极有利的几何图形的相互作用对苯环所示图2。
图2:可能的在苯二聚体芳香芳香交互模型对计算固定centroid-centroid 5.5的距离。
在板式换热器残留参与交叉链相互作用,两个苯基环的几何图形的方法必然是高度受到限制。回顾总结了交互肽晶体结构中观察到的几何图形。在肽分子内aromatic-aromatic交互晶体都进行了广泛的调查,在螺旋肽包含多个板式换热器残留的情况下,作为例证图3。在这些情况下,几何图形的方法和社会学sidechains大大减少限制(4- - - - - -8,12]。
图3:晶体的肽Boc-Val-Ala-Phe-Aib-Val-Ala-Phe-Aib-Val-Ala-Phe-Aib-OMe Phe-Phe交互。
