表观遗传学在人类疾病中的作用
关键字
表观遗传学,DNA甲基化,基因组表达,表型,发病机制
表观遗传学在人类疾病中的作用
由DNA甲基化、染色质修饰和非编码RNA组成的主要表观遗传机制对健康具有巨大的慢性影响,这些过程中的畸变通常会导致疾病[1-4].然而,基于表观遗传学的疾病预防和治疗方面的各种进展即将出现,并将彻底改变药物和临床实践[5-7].
表观遗传学是研究基因组表达的可遗传变化,这些变化不是通过修改基因核苷酸序列而产生的。越来越多的证据表明,在许多疾病的病因或进展中,表观遗传变化是必要的[8-12].可用于研究表观遗传修饰的机制和后果的技术已经呈指数级增长。这其中的刺激因素是我们对表观遗传变化对表型和疾病病因的重要性的理解和认识的迅速增长,与技术突破相关的是,这些突破使进行大规模表观基因组研究成为可能。本章总结了一些当代研究表观遗传学的方法,并强调了对未来表观遗传学和表观基因组研究具有重大潜力的新技术和策略[13-16].
在许多情况下,基因的失调导致了各种癌症的发生和发展。然而,先进的癌细胞基因组分析提供了除突变以外的可能性的见解,有利于致瘤表型[17-21].表观基因组学研究表明,基因表达可以通过修饰特定的碱基或染色质残基而独立于DNA序列进行调控,这些变化是肿瘤发生的核心。表观遗传标记是可遗传的和可逆的,因此调节这些变化的酶是癌症治疗的潜在靶点。表观遗传酶抑制剂可以恢复表观遗传标记设置的基因表达失衡,恢复启动细胞分化和抑制肿瘤所必需的细胞凋亡的途径。酶,如DNA甲基转移酶(DNMTs),组蛋白乙酰转移酶(HATs),组蛋白去乙酰酶(HDACs),组蛋白甲基转移酶和组蛋白去甲基酶,通过药物抑制剂调节表观遗传途径。
表观遗传修饰在整个发育和产后生活中都是必不可少的。其中一些修饰是可遗传的,可调节后代的基因功能,而另一些表观遗传修饰可调节基因功能,但不遗传[22,24].这些修饰的异常导致异常发育,甚至危及生命和包括癌症在内的各种疾病。建立、维持和修改表观遗传模式的机制相当复杂,涉及数百种蛋白质[25-28].由于表观遗传机制在发育中起着核心作用,人们可以预期许多神经发育障碍与基因编码的突变有关。对这些突变的研究将揭示表观遗传学在神经发育中的作用
[29-31].
常见的严重神经行为疾病,如精神分裂症、双相情感障碍和自闭症谱系障碍(ASD),是由影响表观基因组和受表观基因组影响的遗传和环境因素共同引起的。所有表型和疾病都有表观基因组成分。表观遗传机制的异常功能导致许多先天性神经生物学障碍。近来,营养、药物、心理压力等环境因素被认为是表观遗传变化的原因。此外,青春期环境压力引起的表观遗传变化将持续到成年,并应代代相传[32-34].
自身免疫性疾病也具有强烈的环境决定因素。细胞的表观遗传特征受到环境条件的影响,此外还受到衰老的影响,这加强了年龄、环境因素和病理发展之间所观察到的关系。此外,女性自身免疫性疾病的发病率更高,这可能与x染色体失活有关,这是一种重要的表观遗传事件[35].
肥胖是由饮食、运动等环境因素对现有生活方式的影响而导致的慢性多系统衰弱性疾病之一,非遗传因素在肥胖发病中起重要作用。在小鼠模型中,很少有超重疾病和饮食对表型的调节暗示了这些表观基因组的可能性[36].
表观遗传调控在某些人类疾病的病因学中已被明确地牵连。表观遗传学在精神障碍的起源和表现中起着重要作用。在人类的整个生命周期中,大脑保持着灵活性和反应性。在细胞水平上,大脑的许多功能都伴随着基因表达的变化。组蛋白改变和DNA甲基化等表观遗传机制稳定了基因表达,这对信息的长期存储很重要。一些用于治疗精神疾病的药物通过改变基因表达起作用。这些发生在基因表达中的修饰通过表观遗传机制(DNA甲基化和组蛋白修饰)稳定下来,逆转了疾病的影响[37].
2型糖尿病是一种多基因、多因素的疾病,其特征是由于胰岛素分泌和作用受损而导致高血糖。表观遗传机制,进一步如聚合物甲基化和组蛋白修饰,可能提供了环境因素和基因组之间的联系,从而影响2型糖尿病的风险。目前的研究表明,2型糖尿病的非遗传风险因素,如衰老、超重和免疫力低下,与该疾病靶组织的表观遗传变化有关[38].此外,与非糖尿病患者相比,2型糖尿病患者表现出不同的DNA甲基化,这表明表观遗传机制可能在该疾病的发病机制中发挥主要作用[39].
心血管疾病,如动脉粥样硬化和心脏病,是世界上主要的公共卫生问题和死亡的主要原因。该病的几个危险因素,如吸烟、高脂血症和高血压,已被确定,但疾病发展的机制仍有待研究[40-44].心血管系统的表观遗传修饰在心血管疾病的发病机制中发挥关键作用[45].表观遗传修饰直接或间接地影响血管细胞的生长、迁移和凋亡。一些微生物,如细菌和病毒感染,经常引起宿主细胞的表观遗传改变[46-49].
DNA甲基化等表观遗传因子在基因表达调控中起着重要作用。DNA甲基化缺陷可能导致影响胚胎发生、基因组设计和癌症的疾病。表观遗传学可能是人类遗传学的一个迅速发展的领域[50-56].与人类基因组测序加速了对遗传疾病和癌症的分析一样,预计规定正常人类表观基因组的倡议将促进对表观遗传学在人类疾病中的作用的更高理解[57-60].
确认
我要感谢我的同事Rakesh M和Sateesh V的支持,他们提供了适当的指导。本内容由Murali M.审核批准。
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