表观遗传酶和itA¢€™年代有机化学

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在核小体,DNA和组蛋白蛋白质遭受一系列令人眼花缭乱的化学变化,在类型和频率。因此,核小体可能会生活在一个大量的化学性质不同的国家远比可见phenotypicstates的先进。然而,它可能是复杂和协作,拥有大量的闲置原始生物的表现型的国家,如果有一个“组蛋白法”。尽管表观遗传国家可能被认为是有价值的数据,在化学位置,表观遗传略记涉及两种简单的有机反应中第一次遇到的本科有机化学课程,即酰化和烷基化的亲核试剂。在下面的讨论中,磷酸化的丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸余数是故意地忽视了。尽管组蛋白蛋白质磷酸化,有大量的on-epigenetic过程也涉及这翻译后修订。

(一)赖氨酸酰化

组蛋白蛋白质的氨基端尾包含多个介绍性的赖氨酸和精氨酸余数。组蛋白乙酰转移酶(帽子)酶采用驱动酰基辅酶A捐助者1赖氨酸余数转换为相应的acyl-lysine残渣。近20的头饰是知道核和胞质分布不同。通过序列同源性,一些头饰被组合在一起的小昆虫,神秘岛和SRC的家庭,而其他类似的手表是结构不同。头饰的主要反应是赖氨酸乙酰化作用,这不仅增加了侧链的大小,而且也改变了其净电荷从1在生理pH值为零。虽然乙酰化作用可能主要反应催化了头饰,至少其中一些酶接受各种其他low-molecularweight酰基捐助者不同大小和电荷。说明,附件二元羧酸酸相似的丙二酸酯不仅增加赖氨酸侧链的大小,还导致了净电荷的目前未知是否每个酰化有其独特的表型反应,或者只是反映了随机过程依赖于细胞酰基捐助者的人口。同时,酰化并不限于低分了——体重捐助者,长链羧酸相似的生物素和肉豆蔻酸可以被转移。

(b) Acyl-lysine脱酰作用

脱酰作用后反应的赖氨酸乙酰化和实现两个不同的类的酶zinc-dependent组蛋白去乙酰酶抑制剂(hdac)和sirtuins蛋白(sirt)。生物,hdac和sirtuins蛋白的作用返回acyl-lysine余数故土质子化了的赖氨酸。核小体,这导致收缩的染色质和基因沉默。重要的抑制这些酶的兴趣在于前面的重组扑灭压抑的途径,类似肿瘤压迫、DNA形式,免疫调节和细胞凋亡在癌细胞。在人类中,有11个HDAC亚型进一步细分根据序列同源性和本地化。类我是无处不在的核HDAC1、HDAC2 HDAC3 HDAC8,组蛋白的蛋白质可能是一个重要的基质。类活动花絮HDAC4、HDAC5 HDAC7和HDAC9 towel-specific分布,大小比类酶,航天飞机在激活和细胞质之间的联系。还有IIb类HDAC6 HDAC10, HDAC11放置在单独的四级由于平行一级和二级。这些hdac metallohydrolases雇佣一个电荷传递媒介,积极点锌(II)阳离子通过合作加速水解的羰基酰胺和水在中间2。

(c)赖氨酸和精氨酸甲基化

除了酰化,其他主要在表观遗传学是烷基化操作。在赖氨酸甲基转移酶的活性点,亲核攻击的自然亲电甲基赞助人S-adenosylmethionine 6(山姆,图4)赖氨酸反面产生甲基化余数和S-adenosylhomocysteine 7 (SAH) -产品。成熟的人类,赖氨酸甲基转移酶(国民党)分享一套催化领域命名的Su (var) 3 - 9日Enhancer-of-zeste和Trithorax果蝇蛋白质有关。不过,虽然有近50的蛋白质包含设置学科,不是都有可证明的赖氨酸甲基转移酶。此外,还有赖氨酸甲基转移酶相似DOT1L(端粒的沉默1-suchlike粉碎机)不包含一组球体。一旦第一个甲基添加给特制产品,由国民党更远的甲基化酶导致dimethylated Kme2或trimethylated Kme3余数。由于许多国民党内部的蛋白质家族,他们的标题是复杂的。国民党是细分为八个亚科KMT1 - 8和个别成员是由新鲜的描述符表示。增加了并发症,大量蛋白质第一次被发现是在果蝇和传统文献中广泛使用的名称。