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MOLELAR提供和RAP分析

Divya Pal一号Madhulika Singh2
  1. 基什那理工学院生物技术系,印度勒克瑙
  2. 生物技术系CytoGene研发公司,印度勒克瑙
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抽象性

研究番茄和番茄F1混合体及其双亲分别使用22和15个标定10基单片RAPD素数识别和基因纯度测试本研究分析RAPD标识对crigi(capsicum)混合体及其父母特征的适配性15枚随机素数分析中,三种素数OPC-08、OPL-12和OPV-14以放大产品形式产生可辨识结果本研究还分析SolanumlycopericumF1混合体及其父母(男性和女性)与22个不同的开关素数识别带模式,以区分双亲和混合体RAPD22素数中只有5位素数显示雄性、雌性混合带间多态带间,OPA-05、OPA-09、OPN-14、OPG-04和OPK-02多几大几率通过自定义亲子关系和混合开发程序期间与其他植物跨出而受污染严重影响混合生产质量分子标识工具可有效用于查找DNA多态性相关混合中的此类沾染

关键字

Solanumlycopericum,Capsicum,RAPD标记,F1混合体,遗传纯度

导 言

培植番茄Lycopericumesculentum Miller(Solanceae)非常重要,因为果实高值新鲜消费番茄是一种草莓,通常是Solanaceae或Endershade家族的无序植物,通常为摘果供人食用而种植。分类密钥、成熟果红色内部果直径、叶子分解、插点短、密初和大型acresantclyx[1]并发布于番茄遗传合作由分子标记检测到的番茄栽培物内部的遗传差异也可以用于栽培物识别和保护植物育种者知识产权(植物育种者权利PBRs)。在所有研究中报告数据处理番茄栽培物标识应用方面非常有用,并提供了重要的背景信息解决PBRs问题[2,3]Chili(Capsicumspp.)是印度最受欢迎和最广种菜之一奇里丰富维他命ACE正被用作香料调味品、菜菜料补充品、药材和装饰植物Capsicum果实[4]工厂有各种名称指向地点和类型英国常有辣椒、辣椒、红辣椒或绿辣椒或辣椒,分子标记是基因型识别和研究植物基因组组织与评价的重要工具[5]随着分子生物学技术的出现,开发了大量高效脱氧核糖核酸标识物以识别遗传多态性RAPD标记是匿名脱氧核糖核酸序列放大产物
分析不同物种、种群和个人之间或内部的遗传多样性和关联性是有效使用和保护植物遗传资源的先决条件[6]分子标记有许多长处,如多态丰度、无膜效果、受环境较少影响并快速检测[7].使用RAPD研究的长处是,它需要小量脱氧核糖核酸,短素数任意序列,快速筛选多态性,易快捷和成本效益[11]

材料和方法

在这次调查中研究10个番茄样本新鲜叶组织所有样本都用于脱氧核糖核酸提取.DNA使用cetytriphonebroject法提取共使用22位Operon技术样本,并用15位本研究随机素数列表如下:
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PCR反应使用含10XTaq脱氧核糖核酸聚合物缓冲2mMMMgCl2、2.5mddNTPs、5mmgripss、4mlTaq脱氧核酸聚合物、30-40ng模板脱氧核糖核酸脱氧核糖核酸放大程序程序设计如下:DN热循环5分钟94oC,Annaling45秒55oC和扩展1分钟72oC循环数重复为35完成后样本存储于4oCPCR放大产品通过1.5%agares凝胶与1XTBE缓冲分离后在Gel文档系统可视化

结实和讨论

分子标识成功用于genusCapsicum选择双亲混合生产、内部或间分类以及变异分析商业辣椒品种分子多态度低[12]研究中分析15位素数在这15位素数中,3位素数(OPC-08、OPL-12和OPV-14)显示混合多态带番茄(Lycpericum Eculentum)测试22位素中只有5位素(OPA-09、OPA-05、OPN-14、OPG-04和OPK-02)显示多态带分雄性样本和混合样本番茄(Lycpericumesculentum)比对混合带模式时,POPA-09、OPA-05、OPN-14、OPG-04和OPK-02显示多态带,可用以区分混合带和父母使用这些素数确认混合体系相关父母在所有5位素数中,OPN-14显示最大多态带数,因此可高效用于基因纯度测试
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类似地,Chilli(Capsicum)筛选15位素数。 在这15位素数中,只有3位素数显示多态带显示可复制结果的三大素数为OPV-14、OPC-08和OPL-12OPV-14immer显示最大多态化,F1混合体和criki(Capsicum)样本父母间多态带数最大0PV-14初级素可进一步分析番茄混合样本和父样本的差分也可以用来检验番茄基因纯度
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结论

RAPD标记发现基因映射、人口遗传学、分子进化遗传学以及植物和动物育种等广泛应用主要原因是RAPD技术速度、成本和效率短短时间生成大量标记比前方法高因此,RAPD技术大都可在中度实验室应用ARAPD方法可能很重要, 只要其他基于脱氧核糖核酸技术在成本、时间和人工方面仍然无法使用植物种类的分子指纹对保护植物育种者权利至关重要 。 [14][15] 本研究中RAPD番茄和辣椒剖面图显示,RAPD可证明对识别双亲混合物非常有用使用分子标记区分混合线和亲子线的方法效率高精准研究表明,生成多态带的素材可进一步用作多态标记,证明在番茄和辣椒测试中识别和遗传纯度测试大有希望

启蒙

感谢CytoGene研发Lucknow在整个研究工作中提供设施和友好支持我们也感谢全能者

引用

  1. 里克CM.J.W.de Verna和RT.切特利特实验进化番茄 从相关野外阴影,园艺生物技术纽约 本奈特.b.和S.公元前O'Neill编辑,pp19-30,1990
  2. 库克市J.G.M.M.布里德梅费尔W.加纳尔市peters.PIsaac和SRendell.,demisticsatletliteloci小麦和番茄品种一致性评估Ethytica132,331-34123
  3. 马丁内斯G.L.安德里亚尼G.关萨诺Geuna和JJ.Ruiz评估放大片段多态学和简单序列重复番茄克隆指纹:实用性分组关系密切的传统栽培基因组49,648-656,2006年
  4. BerkeTG和ShihSCCapsicumPeterKV手册木头出版有限公司剑桥市,111-122,2001
  5. Joseph A类动物分类评审Rudick危险产品科环境健康局健康福利局,加拿大,1993年
  6. weisingK公司、Atkinson RG公司和GardnerRC公司使用微型卫星PCR基因指纹评析:批判性评价PCRMETHAppl4 249-255,1995
  7. SingAK SinghM SinghAKSinghRKKKARMARMSGLOLOUGMLEGLEGLEGLOLEGLEGLEDSLETERDGETSLEDSLETERSLEGLE库鲁尔科学文献90,711-714,2005年
  8. Faruque MO、MeahMB、BegumSN和Khalil MI研究孟加拉国茄子栽培器遗传变异Bangladesh J.阿格里克36(1),11-19,2011年
  9. Makari Hktri、Patil HSR、AbhishatM和KumarHDM,印地安J科学文献技术诺尔2(4),91-94,2009年
  10. swasMS、AkhondAY、AlaminM、KhatunM和KabirMR,使用RAPD标记的十种有前途茄子基因关系植物组织礼服生物科技19(2),119-126,2009年
  11. WelshJ和McClelandM使用多功能开源码打印基因组核酸Res18:721318.1990