人类微生物组的系统发育和标志基因分析

关于这项研究

人类微生物组是指所有微生物的聚集居住在皮肤、精液、唾液、口腔黏膜、结膜、乳腺、肺、胆道、胃肠道以及相应的解剖网站,他们这样做。古细菌,真菌和病毒是人类微生物群的一些例子物种,即使他们可以存在于人体。许多细菌包含大致相同数量的非人类细胞的人类细胞生活在人类。一些微生物生活在人类是共生的,这意味着它们生活在一起没有对人造成伤害。其他人与他们的人类宿主共生。识别个人组成一个微生物群落,包括细菌、真核生物和病毒的主要挑战是了解人类微生物组。

基于脱氧核糖核酸的研究通常用于此,而核糖核酸、蛋白质和代谢物也进行了基础研究。有针对性的扩增子研究和最近猎枪宏基因组调查是基于DNA的两种主要类型的微生物研究。围绕人类微生物组的关键问题之一,除了仅仅是描述其化妆品是是否有一个核心或者是社区的一部分,大多数人类的特征。Metagenome汇编程序通常有低质量和许多恢复基因是不完整或分散,计算约束为这种类型的研究比单一的基因组。信息可以用来做一个功能注释基因识别阶段后乘以调整目标对直接同源基因数据库。

标志基因分析是一种方法,利用引物集中在一个特定的基因组区域,允许测定不同类型的微生物的发展史。基因区域的特点是高度可变的地区能够提供精确的识别、接壤保守序列,作为PCR引物结合位点。16 s rRNA基因是主要的基因用于定义细菌和古生菌,而内部转录间隔区用于标识真菌。方法是理想的样本,可以通过宿主DNA污染,因为它是快速、廉价和允许低分辨率微生物的分类。

相比表现出最丰富的口腔和肠道,皮肤和阴道位置显示更少的多样性。每个人都有一个独一无二的结合细菌在身体每个地方,无论是种类和数量。许多亚型的分布于整个口腔的细菌物种选择住在截然不同的部分。甚至曾被认为是了解在人类肠道菌群来自各种各样的社区与模糊分类边界。

致病性细菌是禁止进入的身体皮肤作为一个障碍。微生物可以生活在或在皮肤上的一个人,可以是永久居民或瞬变。根据一个人的皮肤类型,不同类型的微生物存在。大多数微生物喜欢与腺体或住在皮肤表面的细胞。氨基酸、水和脂肪酸给这些腺体的细菌,如出汗或油腺体。此外,当地的细菌中发现油腺体通常革兰氏阳性和潜在的危险。

致病性细菌是禁止进入的身体皮肤作为一个障碍。微生物可以生活在或在皮肤上的一个人,可以是永久居民或瞬变。根据一个人的皮肤类型,不同类型的微生物存在。大多数微生物喜欢与腺体或住在皮肤表面的细胞。氨基酸、水和脂肪酸给这些腺体的细菌,如出汗或油腺体。此外,当地的细菌中发现油腺体通常革兰氏阳性和潜在的危险。