基因多态性研究进展
基因多态性研究进展
基因多态性是个体患者、群体或人群之间DNA序列的差异。snp、序列重复、插入、删除和重组等来源[1-4].遗传多态性也是偶然过程的结果,也可能是由外部因素(如病毒或辐射)引起的[5-8].如果病人之间DNA序列的差异已被证明与疾病有关,它有时会被称为基因突变。经证实由外部因素引起的DNA序列变化通常被称为“突变”,而不是“多态性”[9-14].
基因突变是遗传多态性的一种形式。基因突变是产生基因的聚合物序列的永久性改变,该基因序列与大多数个体中发现的序列不同[15-19].突变将对任何地方产生影响,从一个聚合物(DNA)组成部分(碱基对)到具有多个基因的染色体的超大阶段[17,20.-23].
单核苷酸多态性可能是脱氧核糖核酸的单碱基突变,单核苷酸多态性是遗传多态性的常见来源[24-27].CYP2C9和CYP2C19基因多态性已被证明具有临床后果,导致受影响个体内某些药物的毒性,并将改变替代药物的疗效[28-31].
药物代谢酶的多态性对药物医疗的个体间差异具有重要意义。导致药物代谢双曲、减弱或消失的变异基因影响药物反应和药物不良反应的风险[29,32].遗传改变体现为单核苷酸多态性和基因拷贝数变异。这种变异性目前在整个药物开发过程中都很重要,对常规药物处方也很重要。有许多不同的药物含有药物基因组标签,处方前进行基因分型是必要的或建议的。因此,药物代谢基因的预测基因分型有助于设计个性化、更安全、更经济的药物治疗方法[33-35].
miRNA途径中的遗传变异或多态性与疾病的预后和进展以及药物反应有关,并日益成为审查疾病生物学的有力工具[36,37].MicroRNA多态性可能会干扰miRNA介导的细胞功能调节,而且可能不仅存在于miRNA靶基因中,还存在于前、前、成熟miRNA序列中,存在于参与miRNA生物发生的基因和miRNA顺式调节组分中。miRNA在耐药性和miR多态性中的作用的发明,以预测药物反应结果,这是生物医学科学中一个称为miRNA药物基因组学的新分支的发展[38-40].miRNA多态性的检测可能会改善患者的检测、治疗和预后,并在药物基因组学和个性化医疗领域具有深远的意义。
药物遗传学集中研究单个染色体突变的药理学后果,而药物基因组学则试图同时研究各种基因及其相互作用[41].CYP多态性的基因分型为了解异种生物对人体的影响提供了必要的遗传信息。在药物代谢方面,CYP2C9、CYP2C19、CYP2D6、CYP3A4/5编码基因的多态性最为重要,可导致治疗失败或严重不良反应[42].编码CYP1A1、CYP1A2、CYP1B1和CYP2E1的基因是最重要的负责化学物质生物转化的基因,特别是致癌前物质的代谢激活。
遗传多态性引起的药物毒性是药品开发和临床应用中的主要问题。药物遗传学是研究药物反应的基因控制变异[43].基因多态性包括单基因变异引起的单基因变异,多基因是发生在两个或多个基因上的变异。
先天性免疫和适应性免疫相关基因的多态性已成为造血干细胞移植(HSCT)并发症的主要研究对象。维生素D受体(VDR)基因多态性和各种乳腺癌和卵巢癌的风险已在许多流行病学研究中报道。snp通常存在于人的DNA中。它们作为生物标记来发现与疾病相关的基因[44].SNPs产生于基因内或基因调控区域附近,通过对基因功能的损害在疾病中起主要作用。研究人员发现,snp可能有助于预测个体对某些药物的反应、对环境因素(如毒素)的易感性以及患上特定疾病的风险。
药物代谢酶的遗传多态性使得种群中不同的亚群在执行结合药物生物转化反应的能力上有所不同。多态性区域由这些酶的基因突变产生,通过多种分子机制导致加速器表达或活性减少、增加或缺失[18,24,44].遗传多态性代表了一大类药物和异种代谢酶。
遗传多态性已耦合到3类表型,支持药物代谢的程度。药物的深度代谢(EM)具有常规人群的特征;代谢不良(PM)与特定药物底物的积累有关,通常是一种常染色体隐性性状,需要突变和/或缺失两个等位基因进行表型表达;超广泛代谢(UEM)导致药物代谢增加,是由基因扩增引起的常染色体显性特征[45].药物代谢的遗传变异是导致个体间药效差异的主要原因。
由均衡选择维持的极端遗传多态性(因此被称为几个基因区域单位通过罕见等位基因优势机制维持在非常平衡的结果)与自我/非自我歧视的重要任务密切相关。植物、动物和真菌的各种不同的自我识别系统都有许多共同的选择,此外,它们以相对均匀的频率维持着大量的等位基因,而且这种变异在相当长的时期内持续存在。46].由于平衡多态性的进化动态与中性遗传变异的进化动态有很大不同,平衡多态性的数据已被用作种群历史推断的新来源。
确认
我要感谢我的同事Rakesh M和Sateesh V的支持,他们提供了适当的指导。本内容由Murali M.审核批准。
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