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抗生素耐药性的模式铜绿假单胞菌菌株分离微生物标本

Duygu Kubra金枪鱼*

Hacettepe大学微生物系,安卡拉,土耳其

*通讯作者:
Duygu Kubra金枪鱼
微生物学、
Hacettepe大学
安卡拉
土耳其;
电子邮件:duygukubratuna@gmail.com

收到:12 - 9月- 2022年手稿。jmb - 22 - 74372;编辑分配:14 - - - - - - - 2022年9月,PreQC没有。jmb - 22 - 74372 (PQ);综述:28 - 9 - 2022,质量控制。jmb - 22 - 74372;修改后:05 - 1月- 2023手稿。jmb - 22 - 74372 (R);发表:12 - 1月- 2023,2320 - 3528.12.1.001 DOI: 10.4172 /

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文摘

确定抗生素耐药性的铜绿假单胞菌菌株分离样本收集单个中心微生物实验室的四年。样品的伤口,血液、气管吸入、脓肿、阴道、脑脊液、痰液、尿液文化隔绝789患者住院服务,重症监护病房和门诊服务之间2017 - 2020年回顾性评估假单胞菌物种。大多数文化尿(42.7%)和痰文化(20.4%)。大多数病人应用于胸部疾病的服务来自部门(38.6%)或从泌尿外科学系(14.3%)或姑息治疗组(12.5%)。最高的抗性对头孢呋辛,左氧氟沙星和netilmicin;最低的阻力是对阿米卡星。aztreonam、头孢吡肟、庆大霉素抗性显著减少年(分别为P = 0.0321, 0.0038和0.0004)而粘菌素和左氧氟沙星阻力显著增加(P < 0.0001, P = 0.0407)。显著减少观察抗头孢吡肟、头孢他啶、环丙沙星多年(分别为P = 0.0321, 0.0038和0.0004)。显著减少耐药性菌株的分离尿液文化只是观察头孢吡肟/年(P = 0.0003)。痰的抗性菌株分离出的文化,尿液和呼吸道分泌物对左氧氟沙星在2019年显著增加伤口的文化在2020年增加(P = 0.0145)。改变抗生素耐药性概要文件被发现在患者多年来经常由于各种抗菌素的使用。

关键字

抗生素耐药性;文化;铜绿假单胞菌;应变;微生物学

介绍

铜绿假单胞菌是最常见的一种革兰氏阴性细菌引起医院和其他医疗保健相关感染住院患者(1]。它是由于一个特别重要的免疫功能不全的患者的发病率和死亡率的主要原因,影响住院病人的主要医院病原体,本质上是对多种抗生素产生抗药性(2- - - - - -4]。

铜绿假单胞菌是有机体自然发现在许多不同的环境中,然而,它可以分离出各种各样的生活来源,如动物,植物和人类。的生存铜绿假单胞菌最低限度的营养需求和它能够容忍各种各样的物理条件的原因其生存能力在这两个人口和医院。在医院,铜绿假单胞菌可以从各种来源孤立如呼吸治疗设备、防腐剂、肥皂、洗手盆、垫、药品等(5]。由于它适应自然和高生存能力,它可以从6小时6个月在医院干无生命的表面设置(6]。在过去十年中,抗生素耐药性利率增加由于无意识的使用不当和广谱抗生素和缺乏适当的消毒方法。超过280万抗生素耐药感染发生在美国,每年超过35000人死于结果(7]。在最近的一项研究来自土耳其,总体死亡率铜绿假单胞菌感染在医院发现了46% 68%,碳青霉烯耐药粘菌素敏感铜绿假单胞菌感染患者住院的重症监护室(ICU) [8]。虽然常见的感染预防和控制努力减少死于医院,抗生素耐药性感染有有限的数据量的大小对土耳其这个问题(9]。因此,在这项研究中,我们旨在确定抗生素耐药性的铜绿假单胞菌菌株分离出单一的微生物实验室收集的样本中心的四年。

材料和方法

这项回顾性研究涉及人类受试者的数据是按照道德标准机构和国家研究委员会1964年赫尔辛基宣言及其后来的修正案或类似的道德标准。批准被授予non-interventional研究伦理委员会Bandirma Onyedi Eylul大学健康科学。

样品的伤口,血液、气管吸入、脓肿、阴道、脑脊液、痰液、尿液文化隔绝789患者住院服务,ICU和接收在我们医院门诊服务之间2017 - 2020年回顾性评估假单胞菌物种。从患者的尿液样本来自不同临床标本接种5%羊血琼脂,和伊红美蓝(EMB)琼脂媒体(等实验室、盖布泽、土耳其)。其他临床标本接种5%羊血琼脂、伊红美蓝琼脂和巧克力(朱古力)琼脂板和孵化24小时37°C。孵化的末尾,细菌生长评估由殖民地的存在和类型和文化认为适当的样本被包括在抗菌谱被选为研究细菌鉴定。从患者样本污染,病人的文化发现无法联系,和18岁以下的人并不包括在这项研究。

血液样本接种到血培养瓶(马拉加渲染Horacio Lengo C / N 18日,西班牙)和孵化自动化系统(渲染BC128、自动化血培养系统,济南,山东,中国)。样品,5天之内给增长信号突变革兰氏染色法。前识别后,样本接种5%羊血琼脂,巧克力琼脂和伊红美蓝琼脂媒体和孵化35.5°C -37°C之间的18 - 24小时。

最后24小时孵化的标本801例,常规方法(革兰氏染色法、氧化酶试验、发酵特性)被用来确定生长中的假单胞菌分离株在物种水平检测,和抗生素耐药性利率取决于使用凤凰100 (BD),医学博士,正欲火花自动化系统。药物过敏性被自动化设备24小时后分类。结果是根据评估的建议,“欧洲委员会药敏测试(EUCAST)”(10]。

统计方法

摘要(统计人员统计系统)2007(美国犹他州Kaysville)计划是用于统计分析。研究数据进行评估与描述性统计方法(意思是,标准偏差,值,频率、比例,最小值,最大值),和皮尔森卡方测试是用来比较定性数据。决心在意义p < 0.05的水平。

结果

铜绿假单胞菌菌株分离自789年患者应用到我们医院2017 - 2020年之间包括在这项研究。63.5%的参与者是男性(n = 501), 36.5%是女性(n = 288)。参与者的年龄从18岁到103岁不等,平均为68.90±15.12年。文化单位发送样本的分布显示,35.5%的患者在住院服务(n = 280),应用于综合医院单位22.7% (n = 179)、和41.8%住院的重症监护病房(n = 330)。


文化类型的微生物的分布表明,大部分的文化是尿液文化痰(42.7%)和文化(20.4%)。最常见的类型的文化是导管尖端文化(0.4%)、腹水文化(0.4%)和Cerebro脊髓液(CSF)文化(0.3%)。只有一个阴道分泌物和只有一个胸膜液体培养的微生物检查(表1和2)。

类型的文化 n (%)
脓肿文化 10 (1.3)
痰液培养 161 (20.4)
尿液文化 337 (42.7)
血培养 35 (4.4)
导管尖端培养 3 (0.4)
耳朵文化 15 (1.9)
腹水文化 3 (0.4)
胸水文化 1 (0.1)
脑脊液文化 2 (0.3)
定量呼吸道分泌物的文化 121 (15.3)
阴道分泌物培养 1 (0.1)
伤口文化 100 (12.7)
789 (100.0)
CSF: Cerebro脊髓液

表1。微生物的分布类型的文化。

部门 服务(n = 280) 综合医院(n = 179) 重症监护室(n = 330)
n % n % n %
普通外科 18 6.4 15 8.4 0 0
泌尿外科 40 14.3 76年 42.5 0 0
胸部疾病 108年 38.6 25 14 0 0
重症监护室 0 0 0 0 330年 One hundred.
家庭健康护理 0 0 21 11.7 0 0
内部疾病 25 8.9 4 2.2 0 0
整形外科 11 3.9 13 7.2 0 0
姑息治疗 35 12.5 0 0 0 0
耳鼻喉科学 1 0.4 12 6.7 0 0
传染病 5 1.8 7 3.9 0 0
神经学 11 3.9 0 0 0 0
心脏病学 5 1.8 1 0.6 0 0
紧急 5 1.8 0 0 0 0
妇科疾病 0 0 4 2.2 0 0
心血管外科 5 1.8 0 0 0 0
神经外科 5 1.8 1 0.6 0 0
血液透析 3 1.1 0 0 0 0
物理治疗 2 0.7 0 0 0 0
精神病学 1 0.4 0 0 0 0

表2。根据医疗单位的详细分配部门。

表2代表微生物样本收集详细的单位。大多数病人应用于服务的胸部疾病(38.6%)或部门的泌尿外科(14.3%)或姑息治疗组(12.5%)。大多数患者泌尿外科的应用于多科诊所来自(42.5%)、或胸部疾病的部门(14%)或家庭护理单元(11.7%)。重症监护患者的百分比的微生物样本收集所有病人的41.8%。


发现抗生素的分布电阻测试的执行铜绿假单胞菌而数年所示表3。完全,生物体对抗生素的抗性最高评价对头孢呋辛,左氧氟沙星和netilmicin。阻力最低的是阿米卡星。有机体的阿米卡星耐药性最高在2019年和2020年最低(P = 0.0107)。aztreonam、头孢吡肟、庆大霉素抗性的生物被年显著降低(P = 0.0321, 0.0038和0.0004,分别)而粘菌素和左氧氟沙星阻力显著增加(P < 0.0001, P = 0.0407)。哌拉西林/ tazobactam阻力在2020年2018年最高和最低(P = 0.0148)。其他抗生素的抗性,即环丙沙星、imipenem, meropenem netilmicin年(没有明显变化表3)。

抗生素类型 2017年 2018年 2019年 2020年 P值
n /总 % n /总 % n /总 % n /总 % n /总 %
阿米卡星 9/177 5.1 13/215 6 29/242 12 8/169 4.7 59 7.3 0.0107
Aztreonam 63/145 43.4 83/183 45.4 6/30 20. 0/0 0 152年 42.5 0.0321
头孢吡肟 69/174 39.7 85/212 40.1 35/136 25.7 24/96 25 213年 34.5 0.0038
头孢呋辛 89/89 One hundred. 98/98 One hundred. 101/101 One hundred. 81/81 One hundred. 369年 One hundred. - - - - - -
环丙沙星 75/175 42.9 107/214 50 108/243 44.4 75/169 44.4 365年 45.6 0.5819
粘菌素 10/150 6.7 24/71 33.8 11/11 One hundred. 3/3 One hundred. 48 20.4 < 0.0001
庆大霉素 57/181 31.5 62/214 29日 57/242 23.6 23/170 13.5 199年 24.7 0.0004
Imipenem 44/171 25.7 48/209 23 47/241 19.5 42/166 25.3 181年 23 0.4102
左氧氟沙星 2/12 16.7 0/0 0 106/205 51.7 92/168 54.8 200年 51.9 0.0407
Meropenem 40/170 23.5 45/210 21.4 48/240 20. 30/167 18 163年 20.7 0.6304
Netilmicin 51/97 52.6 44/101 43.6 7/20 35 0/0 0 102年 46.8 0.2413
哌拉西林/ Tazobactam 43/180 23.9 58/215 27 45/245 18.4 28/168 16.7 174年 21.5 0.0148

表3。抗生素耐药性的调查结果的分布铜绿假单胞菌生物的年。

抗生素耐药性的分布铜绿假单胞菌生物在不同的文化类型提出了提出的年表4。考虑的抗菌素耐药性铜绿假单胞菌菌株痰的文化隔绝,伤口和呼吸道分泌物,显著减少观察电阻剖面对头孢吡肟、头孢他啶、环丙沙星多年来(分别为P = 0.0003, 0.0422和0.0335)。明显降低抗菌素耐药性的菌株分离尿液文化只是观察到的电阻剖面对头孢吡肟(P = 0.0003)。菌株的耐药性痰的文化隔绝,尿液和呼吸道分泌物对左氧氟沙星在2019年显著增加伤口的文化在2020年显著增加(P = 0.0145)。抗生素耐药性的微生物的分布对阿米卡星、aztreonam,粘菌素、庆大霉素、imipenem和哌拉西林/ tazobactam没有改变根据年不同的文化类型。

文化 痰液培养 尿液文化 定量呼吸道分泌物的文化 伤口文化 P值
n % n % n % n %
阿米卡星 2017年 4 22.2 2 9.5 2 20. 1 20. 0.8406
2018年 5 27.8 4 19 1 10 2 40
2019年 7 38.9 11 52.4 6 60 2 40
2020年 2 11.1 4 19 1 10 0 0
Aztreonam 2017年 18 46.2 18 33.3 11 40.7 7 41.2 0.7177
2018年 19 48.7 35 64.8 14 51.9 9 52.9
2019年 2 5.1 1 1.9 2 7.4 1 5.9
头孢吡肟 2017年 18 35.3 20. 32.8 15 34.9 8 25 0.0003
2018年 15 29.4 39 63.9 12 27.9 12 37.5
2019年 12 23.5 1 1.6 11 25.6 6 18.8
2020年 6 11.8 1 1.6 5 11.6 6 18.8
头孢他啶 2017年 21 38.2 15 15 15 31.3 9 33.3 0.0422
2018年 17 30.9 29日 29日 15 31.3 8 29.6
2019年 13 23.6 34 34 13 27.1 5 18.5
2020年 4 7.3 22 22 5 10.4 5 18.5
环丙沙星 2017年 23 34.8 18 12.9 15 22.7 8 17 0.0335
2018年 19 28.8 47 33.6 16 24.2 13 27.7
2019年 18 27.3 42 30. 20. 30.3 15 31.9
2020年 6 9.1 33 23.6 15 22.7 11 23.4
粘菌素 2017年 2 14.3 4 36.4 2 18.2 2 20. 0.3074
2018年 7 50 7 63.6 7 63.6 3 30.
2019年 4 28.6 0 0 2 18.2 3 30.
2020年 1 7.1 0 0 0 0 2 20.
庆大霉素 2017年 18 36 12 17.4 13 37.1 6 27.3 0.3649
2018年 15 30. 27 39.1 7 20. 8 36.4
2019年 12 24 24 34.8 11 31.4 5 22.7
2020年 5 10 6 8.7 4 11.4 3 13.6
Imipenem 2017年 13 31.7 10 17.9 11 28.2 5 25 0.3763
2018年 10 24.4 19 33.9 12 30.8 3 15
2019年 12 29.3 12 21.4 11 28.2 5 25
2020年 6 14.6 15 26.8 5 12.8 7 35
左氧氟沙星 2017年 2 8 0 0 0 0 0 0 0.0145
2019年 16 64年 44 54.3 21 56.8 11 40.7
2020年 7 28 37 45.7 16 43.2 16 59.3
哌拉西林/ Tazobactam 2017年 13 29.5 13 19.7 5 19.2 6 33.3 0.1577
2018年 13 29.5 22 33.3 10 38.5 9 50
2019年 15 34.1 15 22.7 6 23.1 2 11.1
2020年 3 6.8 16 24.2 5 19.2 1 5.6

表4。抗生素耐药性的分布铜绿假单胞菌生物体在不同文化类型的年。

讨论

铜绿假单胞菌代表一个臭名昭著的院内感染的病原体通常特点是多药耐药(MDR),尤其是在住院病人(11]。成功的治疗严重挑战的内在阻力和自适应生物几乎所有可用antipseudomonal抗生素。因此,理解的抗生素耐药性铜绿假单胞菌在人群中是至关重要的,联合治疗建议治疗引起的感染铜绿假单胞菌为了防止耐药性的发展(12]。在目前的研究中,我们调查了细菌分离,重复源自789年我们的诊所或住院治疗的患者抗菌药物敏感性研究变化应对近年来抗生素治疗。对所有铜绿假单胞菌分离分析了四年,我们发现高水平耐药的头孢呋辛,左氧氟沙星和netilmicin最低电阻对阿米卡星。此外,aztreonam、头孢吡肟、庆大霉素抗性的生物被年显著降低而粘菌素和左氧氟沙星阻力大大增加。

Gysin在最近的一项研究中,et al .,药敏模式COVID-19患者呼吸道革兰氏阴性细菌分离株在瑞士进行调查和高比例的铜绿假单胞菌分离株被发现耐抗生素头孢吡肟的标准治疗(56.3%)、头孢他啶(46.9%)、和meropenem (50.0%)。耐哌拉西林/ tazobactam(65.6%)最高的任何相关的药物测试。对环丙沙星的耐药性在铜绿假单胞菌分离相对较低(15.6%)。我们发现低耐头孢吡肟的比率(34.5%)、meropenem(20.7%)和哌拉西林/ tazobactam(21.5%),下降时间依赖方式而耐环丙沙星(45.6%)高于上述研究但多年没有明显变化(13]。

氨基糖甙类抗生素是一组主要用于治疗各种细菌感染。大量的氨基糖甙类已知日期、阿米卡星、庆大霉素、新霉素、链霉素、卡那霉素、巴龙霉素、妥布霉素通过美国食品和药物管理局(FDA)临床使用(14]。阿米卡星是一种半合成的氨基糖苷类抗生素广泛起诉,活跃的广谱革兰氏阴性的生物体,包括假单胞菌和一些革兰氏阳性微生物(15]。因为阿米卡星是受到少量的氨基糖苷类修饰酶,它是更有效的铜绿假单胞菌比其他氨基糖甙类感染(16]。在研究中,阿米卡星抵抗被发现在1 - 30%之间(17]。在一项由Tozlu凯滕,et al .,耐阿米卡星(30%)被发现小于环丙沙星(48%)和哌拉西林tazobactam(32%)电阻(18]。在我们的研究中,阿米卡星总阻力铜绿假单胞菌被测量为7.3%,比2019年最高(12%)对阿米卡星抗生素耐药性较低的一个主要原因可能是不经常的首选治疗经验。

的电阻铜绿假单胞菌由于酶N-acetylation庆大霉素已经认识很长一段时间(19]。耐庆大霉素各医院检查,观察电阻剖面不同4至51%在文献[20.]。研究Varisli, et al .,庆大霉素抵抗的铜绿假单胞菌隔离从13.2%上升到21%,患者伤口的样本应用于门诊。在我们的研究中,庆大霉素阻力铜绿假单胞菌四年来显著减少从31.5%提高到13.5%,可能由于少使用在诊所。

氟喹诺酮类原料药包括环丙沙星和左氧氟沙星是常用的经验治疗铜绿假单胞菌感染。在一项由Varisli, et al .,抗生素耐药性的铜绿假单胞菌从临床标本中分离出菌株就还研究了多年,也没有增加观察耐环丙沙星的脓肿文化门诊病人在2011年到2015年之间,而阻力增加尿液文化中相同的年从14.2%降至20.3%。他们还发现,环丙沙星耐药的铜绿假单胞菌22 - 25%在脓肿文化和22 - 25.4%在伤口文化。Eyigor的研究,et al .,最高的耐抗生素对环丙沙星(16%)被发现。另一项研究由Ozturk等人发现比率为15% (21]。其他的研究表现在土耳其人口表明,环丙沙星阻力在7.2 - -47%的范围(22,23]。在我们的研究中,总抗菌素耐药性P绿脓杆菌环丙沙星是45.6%,我们的数据与文献相兼容。菌株的耐药性与痰液明显减少的文化年,但总电阻剖面并没有改变。另一方面,耐药性的菌株痰的文化隔绝,尿液和呼吸道分泌物对左氧氟沙星在2019年显著增加伤口的文化在2020年显著增加。这种情况的原因可能是喹诺酮组的频繁使用抗生素经验性治疗尿路感染的门诊以来最常见的微生物样本收集的尿液文化。相对较高的耐环丙沙星表明这将是适合应用这些氟喹诺酮类原料药结合beta-lactam [24,25]。

结论

碳青霉烯类抗生素广泛beta-lactam和不受许多水解酶的影响。的总体死亡率铜绿假单胞菌感染在医院被发现增加的碳青霉烯耐药粘菌素敏感铜绿假单胞菌感染。考虑我国研究,观察到著名的碳青霉烯,imipenem抵抗的铜绿假单胞菌Varisli隔离不同的3 - 53%,等人报道,电阻率铜绿假单胞菌菌株对imipenem和meropenem EUCAST标准确定的住院病人明显减少从31%降至29%。Tozlu凯滕等人发现imipenem阻力由EUCAST标准为31%,和meropenem抵抗27%。由EUCAST标准,我们发现imipenem阻力铜绿假单胞菌隔离23%,meropenem阻力20.7%都没有显著变化。数据与文献一致。

Piperacillin-tazobactam经常用于治疗铜绿假单胞菌感染的危重病人。在一项研究中,piperacillin-tazobactam阻力的百分比铜绿假单胞菌隔离被发现39%根据EUCAST标准。在我们的研究中,总抵抗piperacillin-tazobactam是21.5%,低于之前提到的研究,表明不同的患者人群和类型的疾病。


连续变化的抗菌素耐药病人隔绝铜绿假单胞菌复杂的经验治疗方案。因此,为了确定有效的治疗方案,有必要定期检查微生物及其每个医院的抗生素耐药性。的结果评估,抗生素耐药性的变更概要文件中检测出患者多年来经常由于各种抗菌素的使用。氨基糖甙类的组合与antipseudomonal beta-lactams或喹诺酮类药物被认为是适当的在门诊病人的经验治疗铜绿假单胞菌感染。结果,及时和准确的解释抗生素敏感性测试已被发现是非常成功的至关重要的抗菌治疗。

声明和声明

相互竞争的利益

作者没有相关的财务或非财务利益披露。

作者的贡献

作者的研究和设计概念。DKT进行数据收集和分析。第一稿的手稿是DKT和DKT评论写的以前版本的手稿。DKT阅读和批准最终的手稿。

伦理批准和同意参与

这项回顾性研究涉及人类受试者的数据是按照道德标准机构和国家研究委员会1964年赫尔辛基宣言及其后来的修正案或类似的道德标准。批准被授予non-interventional研究伦理委员会Bandirma Onyedi Eylul大学健康科学。

确认

作者感谢协会。泰姬谭博士教授托伦从Bandirma Onyedi Eylul大学对他的支持。

引用