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两种淡水鱼，鲱鱼和鲤鱼视黄醇结合蛋白的比较研究

摘要

Retinol-binding蛋白质(RBP)是一个具有多种功能的蛋白质家族。它们是结合视黄醇的载体蛋白。一个在网上进行了三维结构预测和分子研究系统发育两种淡水鱼的RBP分析鲤属carpio．利用分别从Gen Bank和UNIPROKB/SWISSPROT数据库中提取的rbp基因和视黄醇结合蛋白的序列数据进行分析。采用最大似然法和最大简约法在MEGA5中对rbp基因进行了进化分析。本研究采用最大简约和最大似然两种不同的方法，将比较建模方法应用于RBP基因的三维结构预测和meg5中RBP基因的分子系统发育分析。经统计验证后，将预测结构存入蛋白质模型数据库(PMDB)。研究表明，rbp基因鲤属carpio最近的是直接同源rbp基因的变异。RBP的结构有助于进一步研究其活性位点、功能分子机制和基于结构的系统发育。该结构将有助于进一步了解rbp -视黄醇复合物与淡水鱼转甲状腺素的相互作用。系统发育树揭示了RBP家族的进化关系。

Chittaranjan Baruah, Papari Devi和DK Sharma

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