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机器学习方法发现小说非核糖体多肽合成酶(nrp)植物生长促进假单胞菌的基因组

文摘

Non-ribosomal肽合成酶(NRPSs) multi-modular megasynthasespossessing催化生物合成能力的小生物活性肽通过thiotemplate mechanismwhich独立于核糖体。这些酶是参与生产多种化工产品的广泛的结构和生物活性。目前的研究,目的是开发一个执行基因预测工具使用机器学习工作台WEKA(怀卡托环境知识分析)呼吁nrp在植物生长促进假单胞菌spp.First,他开发了一个模型使用训练数据使用许多生成分类器。训练模型被用于预测nrp在给定的一组未知序列。交叉验证结果表明,“Logisticof功能”是最好的分类器相比,在分类精度高和性能的实例。我们希望这个工具将帮助发现小说nrp的预测从序列数据获得的全基因组测序的细菌宏基因组。

菲利普工作N。,Jamshinath tHemalatha N。,拉杰什表示抗议