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与其他苋科比较叶绿体基因组分析的碱蓬aralocaspica基因组

文摘

叶绿体是植物的半自治的细胞器食品制造系统所必需的。叶绿体基因组是目前研究广泛的比较分析可能有助于阐明物种同一植物的家庭之间的区别。碱蓬aralocaspica是一个单细胞C4植物物种属于家庭苋科亚科下Suaedoideae。然而,并不是所有的植物都在Suaedoideae利用C4光合作用的大多数植物物种利用C3光合作用。因此本研究旨在评估美国aralocaspica的叶绿体基因组和与其他四个苋科物种进行比较分析。叶绿体基因组的s aralocaspica通过叶绿体隔离和DNA测序以及基因组组装和注释。比较基因组是由基因的序列分析以及串联重复序列的测定。美国aralocaspica是151225个基点的长度编码77517个基点的大小。86年共有140个基因,蛋白质编码。有20个重复基因在爱尔兰共和军和IRb还有16 intron-containing基因。 Results from 70% cut off sequence identity showed that S. aralocaspica varied with other species more apparently in the arrangement of few genes such as matK, atpF, rpoC2, rpoC1, ycf6, psbM, clpP, petB, rpl16, ndhA, and ycf1. A total of 66 tandem repeats were found in all of the studied species, most of which is situated in the intergenic space. Comparative chloroplast genome analysis showed that S. aralocaspica is much closer to Suaeda glauca and a little in variance with Suaeda acuminata and the outgroup, Salsola tragus.

J * Caburatan L,公园

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