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比较建模、HYD1质量评估和验证

文摘

HYD1是一个小型真菌分泌蛋白,属于类我hydrophobins g .念珠。它能够自发地在亲水自组装:疏水接口到10纳米两亲的小棒单层。基于这种独特的性质,HYD1参与信号和天线结构的附件(如菌丝,菌丝和孢子)疏水表面的寄主植物真菌发病机理。本文试图构建一个三维结构基于多个模板使用的HYD1小说算法M4T在线服务器上可用。PROCHECK ProSA Verify3D 3 dss,服务器是用来分析生成的模型的质量和一致性。M4T_HYD1模型因此兼容涂料得分值为-5547.2,显示,93.0%氨基酸残基在最青睐的地区(a, B, L)。评估3 d模型和两个模板(2 f26c和2 pl6a) ProSA透露一个兼容的Z得分值为-3.43,-4.31和-4.10,分别指示可比表面能的亲和力M4T_HDY1模板。低RMSD价值目标和模板结构之间的叠加反映高结构连接。因此,预测模型被证明是好批准的几何和能源轮廓,表明该模型是合理的、可靠的为未来的分子对接研究。

矶法Mawere,苏雷什·库马尔G, Shumbeyi Muzondo

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