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人类原癌基因c-Rel:一种肿瘤发生激活蛋白的三维结构的计算生物建模和分析

摘要

随着生物医学人类科学领域的研究发现，人体中的几种蛋白质对健康有害。原癌基因c-Rel蛋白主要存在于人体内，由REL基因编码，属于REL /NF- kB转录因子家族，调节多种细胞功能。原癌基因参与细胞分化和淋巴细胞生成并发挥重要作用。原癌基因突变时可能有害并引起癌症。要了解人原癌基因c-Rel蛋白的作用机制，必须了解该蛋白的结构模型，但其三维结构尚未在蛋白质数据库(protein Data Bank, PDB)中报道。本研究对智人原癌基因c-Rel进行了完整的结构分析和三维建模。在PDB Blast报告的基础上，利用SWISS MODEL对原癌基因rel蛋白的三维结构进行了预测。利用save (PROCHEK、VERIFY 3D、ERRAT)和Ramachandran Server对预测模型进行了评价，结果表明，预测值均为可接受值，最终精化模型可靠性较好。总体结果为模型质量良好提供了证据，为实验衍生晶体结构的功能分析提供了充分的基础，也有助于癌症研究，为原癌基因c-Rel蛋白基于结构的药物设计提供了新的起点。

Atala Bihari Jena和Shasank Sekhar Swain

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