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来自大麻表达序列标签的mirna的计算预测、靶标鉴定和实验验证。l

摘要

MicroRNAs (miRNAs)是一种约20-22个核苷酸的非编码rna，通过结合靶mRNA的特定位点，在靶mRNA的转录后降解或抑制蛋白质合成中发挥重要作用。miRNA已经在各种植物物种中得到了广泛的研究，然而，在大麻中还没有发现miRNA，大麻是一种长期用于生产大麻纤维、种子和籽油、药用和娱乐性药物的作物。在这项研究中，使用基于计算的方法来鉴定和表征苜蓿mirna。通过同源搜索和一系列筛选标准，在大麻中共鉴定出3个miRNA家族的7个miRNA。通过终点PCR和定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)对鉴定的miRNAs进行了验证，证实了苜蓿中存在保守的miRNAs。基于大麻mirna与靶mRNA基因序列之间近乎完美的互补，共鉴定出23个mirna靶点，涉及植物发育、信号转导、次生代谢物产生、蛋白质降解、对环境胁迫和病原体入侵的响应以及调节自身生物发生能力等过程。在这些miRNA基因的启动子区域发现了与生物和非生物胁迫、植物激素应答、类黄酮和大麻素生物合成相关的顺调控元件。总的来说，本研究的发现将加速大麻素代谢途径中mirna及其功能的进一步研究

Ganesh Selvaraj Duraisamy, Ajay Kumar Mishra, Jernej Jakse和Jaroslav Matousek

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