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在结核分枝杆菌全基因组筛选的细胞Wall-related模块基于大规模Co-Expression分析

文摘

结核分枝杆菌细胞壁的发病机制中起着重要的作用。是不可能的一个接一个地分析细胞wall-associated基因由于缺乏功能注释。在这里,我们进行基因芯片表达数据的聚类分析,获得33 co-expression模块由三个节点重新网络的建设。总共有555个细胞wall-related基因预测模块中使用多因素logistic回归模型和主题预测分析。模块分析确定了15个基因没有注释,也与细胞壁相关。25模块包含重要的主题,和基因在10这25个模块共享一个共同的主题。方法论的方法利用这可能适用于其他关联基因的识别和描述结核分枝杆菌基因组。这项研究的结果可能会提高对结核分枝杆菌细胞壁的理解,和寻找新的抗结核药物的目标。

卓远鑫Huaidong Wang Bingqiang Liu, Zipeng段,小雨太阳,燕,锋杨,李主任王*,风扇*

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